Pesquisas Vinculadas ao VODAN BR

Para a implementação da plataforma VODAN BR, diferentes frentes de pesquisas foram propostas. Essas pesquisas contam com a participação de alunos da graduação, mestrado e doutorado da UFRJ e UNIRIO, e, quando necessário, com especialistas da área de saúde dos hospitais parceiros.

Pesquisas em Dissertações

As pesquisas associadas ao projeto estão descritas na tabela a seguir com uma descrição sumarizada.

Dissertações associados ao Projeto VODAN BR

Tipo	Projeto	Descrição
Dissertação	Plano de Gestão de Dados Ativos	Elaboração do Plano de Gestão de Dados Ativos para o Projeto VODAN BR
Dissertação	Coleta de Metadados em processos ETL para gerar Proveniência FAIR	Elaboração da coleta de metadados de proveniência referentes ao processo de transformação de dados para o formato RDF (ETL4LOD).
Dissertação	Metadados de proveniência para reuso de dados em Covid-19	Investigação sobre a percepção dos pesquisadores do campo da saúde quanto aos metadados de proveniência necessários para reuso de dados na pesquisa em Covid-19.
Dissertação	Modelo semântico para coleta de dados em Covid-19	Estudo do modelo semântico para o formulário de coleta de dados sobre COVID: uma revisão de vocabulários.
Dissertação	Compartilhamento de dados de pesquisa no contexto da COVID-19	Análise sobre os requisitos dos financiadores de pesquisa em COVID-19 e as práticas e percepções dos pesquisadores quanto ao compartilhamento de dados de pesquisa em COVID-19.

Pesquisas em Trabalhos de Conclusão de Curso (TCC)

As pesquisas associadas ao projeto estão descritas na tabela a seguir com uma descrição sumarizada.

TCC associados ao Projeto VODAN BR

Tipo	Projeto	Descrição
TCC	ETL de Dados Clínicos (HUGG)	Extração, transformação e limpeza de dados clínicos estruturados e não estruturados para carga em uma Base de Dados Relacional.
TCC	ETL4FAIR	Integração do ETL4LOD ao GraphDB e ao FAIR DP. Implementação de APIs permitindo a publicação de dados RDF e sua proveniência na tripestore GraphDB; e dos respectivos metadados de dataset e distribuição no FAIR DP.
TCC	Bussiness Inteligence	Elaboração de Painel para análise de dados coletados em atendimentos de pacientes com COVID-19.
TCC	Ambiente de Contingência para Dados de Pesquisa	Elaboração de Projeto que promova alta disponibilidade para a Infraestrutura do Projeto VODAN-BR.
TCC	Módulo de Gestão de Pesquisas	Implementação de módulo do Aplicativo eCRF VODAN, destinado a criar e atualizar formulários para pesquisas. Os formulários publicados podem ser empregados no módulo de Gestão de Formulários para a coleta de dados que, posteriormente, serão transformados em linked data, associados à artefatos semânticos do domínio da pesquisa.
TCC	ML em dados não estruturados de Prontuários	Implementação de solução para a extração de informações relevantes dos dados não estruturados de Prontuários Médicos.
TCC	ML em dados não estruturados de Prontuários	Análise dos termos adotados em campos não estruturados de Prontuários Médicos e sua correlação com a COVID-19.

Pesquisas e Grupos de Trabalho em Áreas de Apoio a Plataforma

As pesquisas associadas à implementação do piloto do projeto estão descritas na tabela a seguir, com uma descrição sumarizada.

Pesquisas para Apoio a Implementação da Plataforma

Pesquisa	Descrição
Processo de FAIRificação - Workflow	Elaboração de workflow de FAIRificação para atender as especificidades do Projeto VODAN BR
Piloto VODAN BR	Implementação do Projeto Piloto para prova de conceito da Plataforma VODAN BR.
Estudo sobre a disponibilização de dados anonimizados de pacientes do HUGG para a pesquisa	Estudo sobre a estrutura a ser adotada para disponibilizar os dados anonimizados de pacientes COVID-19.
Evolução do Módulo de Gestão de Formulários e aprimoramento do módulo de Gestão de Usuários	Evolução do módulo de gestão de formulários, compatibilizando com as mudanças decorrentes do módulo de gestão de pesquisas.
Estrutura de Metadados do FAIR DP	Elaboração de uma proposta de estrutura de esquema de metadados, empregando o DCAT, para organizar o FAIR DP do VODAN BR
Ferramental de apoio a Gestão de Metadados	Estudo de ferramentas disponíveis para a gestão de metadados e esquemas de metadados a serem adotados no Projeto. Em 2021, foram realizadas análises com a ferramenta CEDAR Workbench e suas formas de interação com outros softwares da Plataforma, como o ETL4LOD.
Vocabulários e Ontologias	Estudo de vocabulários e Ontologias para complementar as informações do Formulário da OMS tratada com a opção de “Outros”
Metadados de Proveniência	Problema de Pesquisa: Quais seriam (que padrões) os metadados para registrar a proveniência do processo de “FAIRficação” dos dados sobre COVID-19 obtidos a partir dos hospitais participantes do Projeto até eles serem depositados em um repositório?
Análise de dados estruturados e não estruturados de Prontuários Informatizados para Pesquisa Clínica	Estudo do Formulário da OMS destinado à COVID associado a análise das informações não estruturadas registradas na Anamnese (acolhimento do paciente) e nas evoluções (acompanhamento de internação). Em 2021, as reuniões realizadas com à equipe de saúde do HUGG permitiram o estabelecimento de premissas preliminares para a extração de informações a partir dos dados estruturados e não estruturados. Essas premissas estão sendo empregadas pela equipe do TCC referente ao ETL de transformação de dados de Prontuários eletrônicas e serão evoluídas de acordo com a necessidade do projeto.

Projetos de Disciplinas da Graduação

1. Para Disciplina de Banco de Dados I

   Trabalho de fim de curso. Para o desenvolvimento dos trabalhos, foram estabelecidas propostas de evoluções no esquema do banco de dados de apoio, elaboração de consultas SQL e desenvolvimento de aplicações WEB, implementando funcionalidades relevantes para o projeto como, por exemplo: Gestão de controle de acesso da base de dados de Apoio para Pesquisas Clínicas, Registro das informações de paciente em um módulo do questionário na base de dados de Apoio para Pesquisas Clínicas e Consultas e visualizações sobre os dados armazenados na base de dados de Apoio para Pesquisas Clínicas.

2. Para Disciplina de Laboratório de Sistemas de Informação II

   Trabalho de fim de curso, visando:

   • 1. Preparar um ambiente no Dataverse com base nos metadados estabelecidos na especificação do FAIR DP, a fim de otimizar o processo de publicação dos dados e metadados do Projeto VODAN BR;

   • 2. Implementar uma solução que acesse o FAIR DP e o Dataverse, via API. A ferramenta deverá realizar pesquisas empregando os metadados disponibilizados no FAIR DP, e buscar, quando demandado, os dataset no repositório de forma mais amigável. Apesar de apresentar uma interface para humanos, o FAIR DP publica informações codificadas que podem dificultar o acesso do usuário. Por trabalhar com termos padronizados, uma aplicação seria capaz de buscar termos em outros artefatos semânticos, inclusive em outros idiomas, auxiliando o processo de busca.